09 Aug 2021 الحكومة الماليزية تعلن فوز معالي الشيخ د محمد بن عبدالكريم العيسى بجائزة العام الهجري الجديد للشخصية الإسلامية الأولى
18 Feb 2019 المجلس الوطني للعلاقات الأمريكية العربية يقرر منح معالي الشيخ د. محمد العيسى جائزة: "السلام العالمي للأديان"؛ تقديراً لجهوده الدولية في تعزيز السلام بين أتباع الأديان
11 Aug 2018 مستشار خادم الحرمين الشريفين، أمير منطقة مكة المكرمة، صاحب السمو الملكي الأمير خالد الفيصل يسلم جائزة الاعتدال لمعالي الشيخ د. محمد العيسى؛ تقديراً لجهوده العالمية في نشر الاعتدال
02 Jul 2018 تقديراً للعَالم الإسلامي جائزة رائد عصر النهضة الأوروبية جالليلو تُمنح هذا العام لمعالي الأمين العام
10 Jul 2017 معالي الأمين العام يتسلم من نائب رئيس الوزراء السنغافوري جائزة جهود تعزيز التقارب بين أتباع الأديان والثقافات، ونشر قيم التسامح والسلام
