23 Dec 2024 مُنح معالي الدكتور محمد العيسى الزمالة الفخرية العُليا لما بعد الدكتوراه الفخرية في القانون من جامعة بولونيا الإيطالية الحكومية
05 Jul 2021 من مقر الأمم المتحدة بجنيف وبحضور نائب أمينها العام.. تكريم أكاديمي للدكتور العيسى من جامعة الأمم المتحدة للسلام
27 Jun 2020 جامعة الإدارة والتكنولوجيا في لاهور بباكستان تمنح معالي الشيخ د. محمد العيسى الدكتوراه الفخرية؛ (لجهوده في خدمة الإسلام والمسلمين)
04 Mar 2020 جامعة مولانا مالك إبراهيم الحكومية تمنح معالي الشيخ د.محمد العيسى شهادة الدكتوراه الفخرية
22 Jul 2019 معهد الاستشراق الحكومي التابع للأكاديمية الروسية للعلوم يمنح الدكتوراه الفخرية لمعالي الشيخ د. محمد العيسى
